Soutenance de thèse de Pascal DEMBELE

Résumé Les maladies à transmission vectorielle sont des maladies infectieuses responsables de plus de 17 % des maladies infectieuses et provoquent plus d’un million de décès chaque année. Ces maladies peuvent être provoquées par des parasites, des virus ou des bactéries, tous transmis par des vecteurs souvent responsables de graves maladies. Notre thématique de recherche nous a conduit à étudier certains aspects basés sur le paludisme notamment l’épidémiologie moléculaire, la performance des tests de diagnostic rapide pour le diagnostic biologique du paludisme, la cartographie des espèces de plasmodiums, l’identification des facteurs qui affectent le respect des directives nationales du diagnostic et du traitement du paludisme ainsi que la prévalence d’autres infections non palustres négligées telles que la borréliose et la mansonellose chez les patients fébriles au Mali. Dans un premier temps nous avons d’abord réalisé une revue de la littérature pour identifier les facteurs qui influencent l’adhésion des prestataires de soins aux directives nationales de diagnostic et de traitement des cas de paludisme en Afrique subsaharienne. Par la suite, dans un second travail, nous avons évalué la performance des tests de diagnostic rapide pour le diagnostic du paludisme et la cartographie des différentes espèces de Plasmodium au Mali. A partir de l’ADN extrait, des tests moléculaires ont été effectués. La distribution du plasmodium falciparum était ubiquitaire avec une prévalence allant de 78,9 % à 100 % des PCR positives, selon les régions. La prévalence de P. vivax a atteint 21,1 % dans le nord. Dans l’ensemble, les tests de diagnostic rapide (TDR) présentaient des indices diagnostiques acceptables. Dans un troisième travail, nous avons utilisé les échantillons d'ADN identiques extraits de tests de diagnostic rapide du paludisme à Plasmodium falciparum, positifs et négatifs, pour détecter les infections zoonotiques par les techniques de biologie moléculaire. L’ADN de B. crocidurae a été détecté dans 5 % (9/180) des TDR testés dans le district sanitaire de Diéma situé dans la région de Kayes. Dans un quatrième travail, concerne l’utilisation de ce diagnostic moléculaire pour étudier la prévalence de la mansonellose chez les patients fébriles. L’ADN de Mansonella perstans a été détecté dans 1,1 % (2/180) des TDR négatifs au paludisme collectés dans la région de Koulikoro. Enfin, la cinquième et dernière partie de ce travail, était l’étude des facteurs qui affectent le respect de des directives nationales de diagnostic et de traitement du paludisme chez les prestataires de soins de santé dans le district sanitaire de Kita. Divers facteurs identifiés, tels que la disponibilité d'un laboratoire fonctionnel, ont montré une association positive avec l'adhésion aux directives nationales de diagnostic et de traitement du paludisme parmi les prestataires (OR = 6,90, 95 % CI [1,05 - 47,65]). Concernant les patients, la pratique de l'automédication était significativement plus élevée dans les zones rurales que dans les zones urbaines. Cette thèse fournit des informations précieuses sur l'épidémiologie du paludisme et la dynamique de la transmission au Mali. En outre, les résultats confirment la présence d'agents de la borréliose à fièvre récurrente et la mansonellose chez les patients fébriles. Notre étude montre qu'une approche intégrée pourrait être utilisée pour détecter le paludisme et la mansonellose ou la borréliose à l'aide de TDR. Des approches intégrées similaires utilisant des moustiquaires imprégnées d'insecticides pour réduire l'exposition de la population aux anophèles vecteurs du paludisme pourraient également permettre de lutter efficacement contre la filariose lymphatique, dont l'agent causal, Wuchereria bancrofti, est transmis par le même vecteur du paludisme. Mots clés : Espèces plasmodiales, Test de Diagnostic Rapide, Prévalence, Mansonellose, Borréliose, PCR; Mali.

Abstract Vector-borne diseases are responsible for over 17% of all infectious diseases and cause over a million deaths annually. These diseases can be caused by parasites, viruses, or bacteria, all of which are transmitted by vectors that often result in serious illness. Our research theme has led us to study certain aspects based on the malaria including molecular epidemiology, mapping of the different Plasmodium species, the performance of rapid diagnostic tests for the biological diagnosis of malaria, the identification of factors affecting compliance with national guidelines for the diagnosis and treatment of malaria, and the prevalence of other neglected non-malarial infections such as borreliosis and mansonellosis in febrile patients in Mali. First, we carried out a literature review to identify the factors influencing healthcare providers' adherence to national guidelines for diagnosing and treating malaria cases in sub-Saharan Africa. We then assessed the performance of rapid diagnostic tests for malaria diagnosis and mapping of the different Plasmodium species in Mali. Molecular tests were carried out on extracted DNA. Plasmodium falciparum distribution was ubiquitous, with prevalence ranging from 78.9% to 100% of PCR positives, depending on the region. The prevalence of P. vivax reached 21.1% in the north. RDTs showed acceptable diagnostic indices. In a third study, we used identical DNA samples extracted from positive and negative Plasmodium falciparum malaria rapid diagnostic tests to detect zoonotic infections by molecular biology techniques. B. crocidurae DNA was detected in 5% (9/180) of RDTs tested in the Diéma health district in the Kayes region. A fourth study concerns the use of this molecular diagnostic to study the prevalence of mansonellosis in febrile patients. Mansonella perstans DNA was detected in 1.1% (2/180) of malaria-negative RDTs collected in the Koulikoro region. The last component of this study was an investigation into the factors influencing compliance with national guidelines for malaria diagnosis and treatment among healthcare providers in the Kita health district. Various factors identified, such as the availability of a functional laboratory, showed a positive association with adherence to national malaria diagnosis and treatment guidelines among providers (OR = 6.90, 95% CI [1.05 - 47.65]). Among patients, the practice of self-medication was significantly higher in rural than in urban areas. This thesis provides valuable insights into malaria epidemiology and transmission dynamics in Mali. The results also corroborate the presence of agents of relapsing fever, borreliosis, and mansonellosis in febrile patients. Our approach shows that an integrated approach could be used to detect malaria and Mansonella infection using RDTs. A similar integrated approach using insecticide-treated mosquito nets to reduce population exposure to the malaria vector Anopheles could also be effective against lymphatic filariasis, whose causal agent, Wuchereria bancrofti, is transmitted by the same malaria vector. Keywords: Plasmodium species, rapid diagnostic test, prevalence, Mansonellosis, Borreliosis, PCR; Mali