Le Conseil de l'ED se réunit tous les deux mois et prend les décisions concernant la politique d'attribution des allocations de recherche, l'organisation d'enseignements, l'organisation des comités de suivi de thèse, l'organisation du colloque et du concours de l'ED, la mise en place d'actions particulières. Il est assisté de deux assistantes. Les doctorants peuvent participer au conseil de l'ED où trois postes leur sont réservés.