Soutenance de thèse de AHAMADA MMADI SAIDOU

Ecole Doctorale
Sciences de la Vie et de la Santé
Spécialité
Biologie-Santé - Spécialité Maladies Infectieuses
établissement
Aix-Marseille Université
Mots Clés
Arthropodes,pathogénes,vecteurs,MALDI TOFS MS,BIOLOGIE MOLECULAIRE,
Keywords
arthropods,pathogen,vectors,MALDI TOF MS,MOLECULARY BIOLOGY,
Titre de thèse
UTILISATION DES OUTILS INNOVANTS DE POINTE POUR L'IDENTIFICATION DES ARTHROPODES D'INTERET MEDICAL ET VETERINAIRE AINSI QUE LA DETECTION DE LEURS MICROORGANISMES ASSOCIES
USE OF INNOVATIVE CUTTING-EDGE TOOLS TO IDENTIFY ARTHROPODS OF MEDICINAL AND VETERINARY INTEREST AND THEIR ASSOCIATED MICROORGANISMS
Date
Mercredi 10 Avril 2024 à 10:00
Adresse
Bâtiment IHU Méditerranée Infection – Site TIMONE, 19-21 bd Jean MOULIN, 13005 MARSEILLE
Amphi IHU
Jury
Directeur de these M. Philippe PAROLA Aix Marseille Université
Rapporteur Mme Christelle POMARES Université de la Côte d’Azur
Rapporteur M. Jérôme DEPAQUIT Université de Reims Champagne Ardenne
Président Mme Florence FENOLLAR Aix Marseille Université

Résumé de la thèse

La première partie de cette thèse est consacrée sur une revue de la littérature portant sur les maladies transmises par les tiques chez l’homme et l’animal en Union des Comores. Les tiques étant vecteurs de plusieurs agents pathogènes, constituent une sérieuse menace en santé publique. Dans ce travail, nous avons utilisé une approche One health afin de rendre accessible l’ensemble des données concernant les maladies déjà décrites aux Comores ainsi que leurs tiques associées. Plusieurs maladies notamment des maladies bactériennes (Rickettsioses, Anaplasmoses et ehrlichioses), protozoaires (Théileriose, Babésioses) et virales (Encéphalite à tique) ont été déjà rapportées dans le territoire avec des prévalences non négligeables. L’apparition de la plupart de ces maladies, particulièrement celles d’origine vétérinaires proviennent suite aux importations d’animaux vivants de la République de la Tanzanie vers l’Union des Comores. Dans la seconde partie, nous nous sommes intéressés sur l’efficacité de l’outil MALDI-TOF MS à identifier les arthropodes. Dans un premier temps, nous avons évalué cet outil sur des échantillons (tiques) dont la durée de conservation en alcool 70% est >10ans en développant deux protocoles nommés PreDO et ReDO respectivement pour les tiques en alcool et ceux dont l’alcool s’est évaporé donc considéré sec. Les resultats obtenus dans cette étude nous ont permis de conclure que l’identification des arthropodes conservés en alcool par cet outil ne dépend pas de la durée de conservation mais plutôt des paramètres du protocole utilisé. Ensuite, dans un second temps, nous avons évalué cet outil pour identifier les 2 espèces de punaises de lit, notamment Cimex lectularius et Cimex hemipterus à leurs stades de developpement ainsi que la discrimination des stades de developpement proprement dit de chaque espèce. Dans la troisième partie, nous nous sommes focalisés sur la recherche des microorganismes associés aux arthropodes. D’abords sur des punaises de lit collectées aux Comores, nous avons recherché des microorganismes susceptibles de les parasités par des méthodes moléculaires. Seule Wolbachia endosymbionte a été detecté. A noté aussi que cette étude, est la premiére à décrire l’espèce de C. hemipterus comme étant la punaise de lit parasitant les maisons infesté aux Comores. D’autres part, nous nous sommes intéressés aux microorganismes associés aux tiques des Comores . Actuellement cette étude est en cours, mais les résultats du screening obtenus jusqu’aujourd’hui nous ont révélés des spécimens d’A. variegatum positif à des rickettsia sp ainsi que la détection de l’espèce de R. evertsi evertsi, une tique signalée pour la premiere fois en 2011 sur des animaux en provenance de la Tanzanie et jamais retrouvée sur d’autres études. Mots clés : Arthropodes, MALDI-TOF MS, microorganismes, Union des Comores, zoonoses

Thesis resume

The first part of this paper is devoted to a literature review of tick-borne diseases in humans and animals in the Union of the Comoros. As vectors of several pathogens, ticks represent a serious threat to public health. In this work, we used a one-health approach in order to provide access to all the diseases already described in the Comoros. We found that several diseases, in particular bacterial diseases (Rickettsioses, Anaplasmoses and ehrlichioses), protozoal diseases (Theileriosis, Babesiosis) and viral diseases (Tick-borne encephalitis), are already circulating in the country with significant prevalence rates. Most of these diseases, particularly animal diseases, originate from the free trade agreement signed between the Union of the Comoros and Tanzania, which facilitates the import of live animals from Tanzania to the Union of the Comoros. In the second part, we looked at the effectiveness of the MALDI-TOF MS tool for identifying arthropods. Firstly, we evaluated this tool on samples (ticks) that had been stored in 70% alcohol for >10 years by developing two protocols called ReDO and PreDO respectively for ticks in alcohol and those whose alcohol had evaporated and was therefore considered dry. The results obtained in this study enabled us to conclude that the identification of arthropods preserved in alcohol by this tool does not depend on the duration of preservation but rather on the parameters of the protocol used. Then, in a second phase, we evaluated this tool for identifying the 2 species of bed bugs, in particular Cimex lectularius and Cimex hemipterus from their developmental stages as well as the discrimination of the developmental stages of each species. The third part focuses on the search for microorganisms associated with arthropods. Firstly, on bed bugs collected in the Comoros, we looked for microorganisms likely to parasitise them using molecular methods. Only Wolbachia endosymbionte was detected. We also looked at the microorganisms associated with ticks in the Comoros. This study is currently in progress, but the screening results obtained to date have revealed samples positive for rickettsiae. Keywords: Arthropods, MALDI-TOF MS, microorganisms, Union of the Comoros, zoonoses.